Стерилизатор заливают дистиллированной водой, что уменьшает образование накипи на металлических частях при многократном кипячении.
Если нет дистиллированной воды, то в обычную воду добавляют щепотку натрия гидрокарбоната (2% раствор). Вода, налитая в стерилизатор, должна полностью закрывать шприцы. Обычно кипячение шприцев и игл продолжается 40 мин после закипания. Если в стерилизатор был добавлен какой-либо инструмент, то кипячение производят еще 30 мин после его добавления. После кипячения сетку со дна стерилизатора извлекают крючками и ставят на его ребро для быстрейшего остывания шприцев. В каждом отделении необходимо иметь специальные стерилизаторы для кипячения шприцев, используемых для введения пенициллина, и стерилизатор для остальных шприцев.

Шприцы с каучуковой оправой кипятить нельзя. Их дезинфицируют в 3% растворе карболовой кислоты, разведенной дистиллированной водой.

Во многих больницах применяют централизованную стерилизацию шприцев и игл в сухожаровых шкафах. Для этого каждый шприц и иглы парами помещают в особый бумажный мешок из специальной силикатной бумаги, заклеенный с обеих сторон. Перед употреблением упаковку вскрывают, достают поршень, вставляют его в цилиндр, не нарушая стерильности. Так же поступают с иглами. После употребления шприц промывают про­точной водой, затем закладывают в дезинфицирующий раствор, состоящий из моющего средства «Лотос» и перекиси водорода, после чего промывают снова, сушат и в сухом виде передают в стерилизационную. Здесь снова проверяют, не осталась ли в шприце кровь, путем закапывания одной капли бензидина. Затем шприцы погружают в 50% раствор уксусной кислоты на 15 мин и кипятят в дистиллированной воде. Сухие шприцы запечатывают и только после этого укладывают в сухожаровой шкаф для стерилизации.